Программа конференции: google docs, xlsx
3 августа
9.00-10.00
Регистрация и утренний кофе
Секция "Генетика"
10.00-11.30
Maria Logacheva
Структура генома и генетическое разнообразие инвазивного растения - борщевика Сосновского
Николай Чеканов
Этногенетический анализ в проекте «100 000+Я»
Виктор Шаманский
Влияние нарушенного общего повтора на здоровое старение на примере гаплогрупп японских долгожителей
Алексей Шмелев
Метод глубокого обучения для определения этноса человека в близкородственных популяциях
Анна Тимощук
Изучение генетического контроля уровней гликозилирования белков плазмы крови человека
11.30-12.00
Кофе-брейк
Секция "Клиническая генетика"
12.00-13.30
Василий Раменский
О пенетрантности болезнетворных вариантов в геноме человека
Андрей Марахонов
Особенности биоинформатического анализа в клинической генетике
Вероника Гордеева
Через тернии к детекции CNV по экзомным данным
Дарья Хмелькова
Роль популяционных баз данных в клиническом анализе данных NGS
13.30-14.30
Обед
Секция "Генетика и медицина"
14.30-16.00
Мария Зайченока
Эффективность шкал генетического риска для оценки уровня липидов в российской популяции
Юлия Медведева
Атлас иммунных клеток в различных этнических группах России в норме и при сахарном диабете II типа
Elizaveta Vlasova
Predicting donor COVID-19 status based on deep profiling of immune repertoires
Elizaveta Rabushko
Детекция химерных окнкогенов по экзонному покрытию 3’-гена партнера
Алина Михайлова
Митохондриальные мутационные спектры: от эволюции позвоночных к онкологии и медицине.
Юрий Гусаров
Мутация Ah->Gh митохондриальной ДНК птиц ассоциирована со способностью к полету и дайвингу
16.00-16.30
Кофе-брейк
16.30-18.00
Постерная секция
Вечер 3 августа
Welcome party
4 августа
9.30-10.00
Утренний кофе
Секция "Транскриптомика"
10.00-11.30
Всеволод Макеев
Assessing Danio rerio neural crest differentiation with single cell transcriptomics at different platforms
Ольга Козлова
Сравнительная транскриптомика регенерации ушной раковины мышей Acomys cahirinus и BALB/c на уровне одиночных клеток
Evgeniy Efimov
Investigation of epigenetic rejuvenation in early embryogenesis using novel single-cell DNA methylation clocks
Anastasiia Gainullina
Maternal serotonin levels cause transcriptional and compositional changes in offspring hypothalamus
Aleksei Chernykh
Comparison and Analysis of Transcriptomic Profiles Associated With Cellular Resistance to Genotoxic Stress
11.30-12.00
Кофе-брейк
Секция "Транскриптомика"
12.00-13.30
Д.Д.Первушин
Структура и посттранскрипционная регуляция эукариотических РНК
Алексей Пенин
Использование гибридного подхода для анализа сплайсинга
Денис Антонец
Использование условных вариационных автокодировщиков и трансформеров для анализа данных scRNA-Seq
Alexey Stupnikov
Hobotnica as a quality measure for a differential analysis
Nicolas Borisov
Uniformly shaped harmonization combines human transcriptomic data from different platforms while retaining their biological properties and differential gene expression patterns
13.30-14.30
Обед
Секции "Транскриптомика, Хроматин"
14.30-16.00
Evgenii Egorov
Identifying conserved transcriptional dynamics across subpopulations of tumor-infiltrating T cells
Александр Модестов
Анализ профилей активации молекулярных путей репарации ДНК и контроля клеточного цикла в разных типах опухолей по транскриптомным и протеомным данным
Anton Buzdin
Large-scale assessment of pros and cons of autopsy-derived or tumor-matched tissues as the norms for gene expression analysis in cancers
Андрей Александрович Миронов
РНК-хроматиновые взаимодействия – Факты и артефакты
Анастасия Жарикова
Нормировка данных РНК-хроматиновых взаимодействий
16.00-16.30
Кофе-брейк
Секция "Хроматин"
16.30-18.00
Lidia Garkul
Search for chromatin-associated RNA orthologues
Arina Nikolskaya
BaRDIC, a new peak calling algorithm for RNA-DNA interaction data
Григорий Рябых
Сравнительный анализ данных РНК-хроматиновых взаимодействий
Дмитрий Звездин
Поиск РНК, ассоциированных с пространственными структурами хроматина
Kirill Polovnikov
Disentangling mitotic chromosomes: a two-stage mechanism
Bogdan Slavov
Crumpled polymer with loops as a model of chromosome folding
5 августа
9.30-10.00
Утренний кофе
10.00-11.30
Секция "Хроматин"
Екатерина Храмеева
Архитектура хроматина и опосредованные ей регуляторные механизмы в различных организмах и модельных системах
Илья Плетенев
Организация хроматина в нейронах коры головного мозга
Дмитрий Крюков
Analysis of chromatin conformation changes in aging neurons
Anastasiia Kashtanova
Evolutionary changes in invertebrate chromatin
Алексей Школиков
CHiMAERa: инструмент для интерпретируемого предсказания карт Hi-C
11.30-12.00
Кофе-брейк
Секция "Регуляция"
12.00-13.30
Иван Кулаковский
Чем и как заполнить «карманный атлас» регуляторных вариантов в геноме человека
Dmitry Penzar
LegNet: a novel approach to modeling regulatory sequences with deep convolutional networks
Валерий Вяльцев
Применение методов глубокого обучения к задаче предсказания связывания транскрипционных факторов с ДНК на основе данных GHT-SELEX
Андрей Буян
Аллель-специфичная активность транскрибируемых регуляторных элементов генома человека в здоровых сердцах и больных кардиомиопатией
Василий Соколов
Анализ генных регуляторных сетей одиночных клеток в поисках комбинации транскрипционных факторов для специфической клеточной дифференциации на примере поджелудочной железы
13.30-14.30
Обед
Секции "Регуляция, Структура, Эволюция"
14.30-16.00
Maria Poptsova
Regulatory potential of flipons revealed by deep learning
Юлия Медведева
Длинные некодирующие РНК в эпигенетической регуляции
Василий Любецкий
Связь видовой продолжительности жизни с эволюцией гена Fbxl21
Olga Vakhrusheva
Зависимость частоты эктопической генной конверсии от взаимного расположения паралогов в мейотическом хроматине Mus musculus
16.00-16.30
Кофе-брейк
Секция "Прокариоты"
16.30-18.00
Maria Tutukina
Регуляция формирования биопленок и подвижности Escherichia coli: факторы транскрипции и некодирующие РНК
Наталия Драненко
Эволюционные траектории вторичных репликонов в многокомпонентных геномах
Ilya Belalov
Searching for Novel Defense Systems in Prokaryotes through the Analysis of Diversity-Generating Retroelements
Анастасия Попова
Эволюция систем рестрикции-модификации семейств RE_AlwI / N6_N4_Mtase x2 и RE_AlwI / N6_N4_Mtase
Георгий Куракин
Бактериальные липоксигеназы связаны со сменой хозяев
Alina Galivondzhyan
Single-nucleotide resolution detection of Topo IV cleavage activity in the E. coli genome with Topo-Seq
6 августа
9.30-10.00
Утренний кофе
Секция "Белки"
10.00-11.30
Юрий Викторович Вяткин
Языковые модели в изучении белков
Алексей Финкельштейн
Как AlphaFold находит структуру белка: предсказывает ли он её на основе физики, или распознает по сходству последовательностей с помощью огромных баз данных?
Дмитрий Иванков
Предсказание эффекта одиночных мутаций на стабильность белка по новым экспериментальным данным
Марина Пак
Знает ли АльфаФолд физику фолдинга: тест распознавания нативной структуры белка из множества вариантов
11.30-12.00
Кофе-брейк
Секции "Белки, Методы"
12.00-13.30
Юрий Мильчевский
Физически и статистически обоснованный подход к составлению предикторов для машинного обучения при предсказаниях локальной и вторичной структур белка является ключевым элементом достижения высокой точности предсказаний.
Sergei Evteev
SiteRadar: Utilizing Graph Machine Learning for Precise Mapping of Protein–Ligand-Binding Sites
Igor Kozlovskii
Identification of allosteric binding sites in KRAS using structure-based deep learning
Leonid Ivontsin
Influence of membrane lipid composition on the proton half-channels structure in FoF1-ATP synthase
Natalya Bogatyreva
Подводный камень итеративного Blast’а
Давид Богдан
Инструмент ARTEM для поиска третичных мотивов в пространственных структурах РНК
13.30-14.30
Обед
Секция "Методы"
14.30-16.00
Andrei Alexeevski
Bacterial defense systems, instruments for block alignments of genomes and protein sequences
М.Г.Самсонова
Better crop made easy или Model-based crop improvement
Сергей Спирин
Бенчмарки для филогенетической реконструкции по аминокислотным последовательностям и получаемые по ним результаты
16.00-16.30
Кофе-брейк
Секция "Эволюция"
16.30-18.00
Anna Speranskaya
Problems for identification of new mammalian viruses: analysis of viromes of bats and insectivores (hedgehogs) caught in the period 2015-2022 in the territory of the Central European part of Russia
Olga A. Kudryavtseva
The PaLTEE: Podospora anserina Long-Term Evolution Experiment
Léo Planche
Detecting multiple episodes of admixture of Neanderthal into Modern humans
Daria Borodko
Evolutionary epigenetic changes in ancient and modern people
М.С.Гельфанд
Сравнительная геномика немодельных организмов
Вечер 6 августа
Farewell party