top of page

Программа конференции: 

Присоединяйтесь к каналу конференции в Telegram, чтобы точно ничего не пропустить!

31 июля, четверг ∨

10:00–10:15

Открытие

​

10:15–11:30
Секция: Хроматин

  • Екатерина Храмеева (30 мин)

    • 3D-геном нейронов человека

  • Алексей Школиков (30 мин)

    • Инструмент интерпретируемого предсказания карт Hi-C

  • Василий Акимов (15 мин)

    • Ремоделирование структуры хроматина в клетках периферической крови у пациентов с тяжелой формой Delta COVID-19

​

11:30–12:00
Кофе-брейк

 

12:00–13:30
Секция: Хроматин

  • А. Грибкова (30 мин)

    • Комплексный биоинформатический анализ хроматома человека

  • Виктор Константинов (15 мин)

    • Анализ трёхмерной организации хроматина с использованием полимерных моделей

  • Дмитрий Старков (15 мин)

    • Interplay between cutoff radius and loop extrusion in interphase chromosomes

  • Анастасия Червинская (15 мин)

    • Simple physical models of active extrusion describe loopy architecture of chromosomes: emergence of a new length-scaleA.

  • Семён Колмыков (15 мин)

    • Роль пионерных факторов в воспроизводимости ATAC-seq экспериментов
       

​

13:30–14:30
Обед

​​​

14:30–16:00
Секция: Старение и эпигеномика

  • Регина Мухаметшина (15 мин)

    • Применение интерпретируемых моделей машинного обучения в метаболомике для анализа возрастных изменений

  • Ксения Матвеева (15 мин)

    • Impaired tissue T-cell immune surveillance is linked to senescent cell accumulation during aging

  • Алексей Мазалов (15 мин)

    • Особенности B-клеточного иммунитета и его возрастных изменений у долгоживущих грызунов Spalax galili

  • Евгений Ефимов (15 мин)

    • Benchmarking epigenetic aging clocks: unifying datasets of DNA methylation in aging-accelerating conditions to create a standardized and clinically relevant methodology 

  • Виктория Палагина (15 мин)

    • Выявление биомаркеров метилирования для определения возраст-зависимых заболеваний

  • Ольга Заякина (15 мин)

    • Анализ метилирования геномных инсерций разных типов
       

​

16:00–16:30
Кофе-брейк

​

16:30–18:00
Постерная сессия

​

19:00–22:00
Welcome party​

​​​​​1 августа, пятница ∨

​​​​10:00–11:30
Секция: Single-omics

  • Леонид Русин (30 мин)

    • The concept of cell assemblability

  • Марат Сабиров (15 мин)

    • Effect of placental serotonin stimulation via maternal signaling on hypothalamic developmental plasticity

  • Николай Бугаев-Макаровский (15 мин)

    • Различия в дорсальном и вентральном отделах гиппокампа при прогрессировании болезни Альцгеймера

  • Мария Черняева (15 мин)

    • Региональный паттерн альтернативного сплайсинга в нейрональных и глиальных клетках здорового головного мозга

  • Екатерина Маркелова (15 мин)

    • Predicting Single-Cell Gene Expression Responses to Small Molecules: A Comparative Analysis of Deep Learning Methods

​​​

11:30–12:00
Кофе-брейк​

​

12:00–13:30
Секция: Транскриптомика

  • Дмитрий Первушин (30 мин)

    • Пост-транскрипционная регуляция экспрессии генов по механизму непродуктивного сплайсинга

  • Александра Озерова (15 мин)

    • Динамика изменения экспрессии генов в процессе полного превращения у Drosophila

  • Софья Прокопчук (15 мин)

    • Tissue specificity of gene expression across 53 species of Angiosperms

  • Павел Никитин (15 мин)

    • Transcription Initiation in Pericentromeric Regions of the Human Genome

  • Мария Тутукина (15 мин)

    • Анализ транскриптомов свободноживущих E. coli K-12 MG1655 и клеток в составе биопленок 

​​​

13:30–14:30
Обед​

​

14:30–16:00
Секция: Эволюция: митохондрии и мутационные подписи

  • Константин Гунбин (30 мин)

    • Молекулярная эволюция митохондриальной ДНК человека

  • Богдан Ефименко (15 мин)

    • Мутационный спектр объясняет свыше 60% наблюдаемых аминокислотных замен РНК-содержащих вирусов

  • Скуднов Алексей (15 мин)

    • Облигатные аэробные бактерии демонстрируют более высокую частоту мутаций A>G по сравнению с анаэробами

  • Евгений Герасимов (15 мин)

    • Быстрая эволюция митохондриального генома трипаносоматид в лабораторных условиях 

  • Дмитрий Фёдоров (15 мин)

    • Судьба дуплицированных митохондриальных генов при двуродительском наследовании у двустворчатого моллюска Yoldia hyperborea (Bivalve, Protobranchia)
       

​​​

16:00–16:30
Кофе-брейк

​

16:30–18:00
Секция: Эволюция

  • Дмитрий Иванков (30 мин)

    • Взаимный знаковый эпистаз можно не найти в многопиковом ландшафте приспособленности

  • Илья Белалов (15 мин)

    • EpiScanFF: Fast Detection of Higher-Order Epistasis in Viral Genomes

  • Ольга Вахрушева  (15 мин)

    • Поиск подписей отрицательного отбора на переходы между стоп-кодонами в данных полиморфизма Homo sapiens и Drosophila melanogaster

  • Иван Ильницкий (15 мин)

    • Эволюция и функции нуклеоплазмина в поддержании структуры ядрышка

  • Виктория Арзуманян (15 мин)

    • Геномная карта клеточных моделей

​

19:00–22:00
Неформальные обсуждения

​​​​​2 августа, суббота ∨

​10:00–11:30
Секция: Модели, алгоритмы и филогенетика

  • Фёдор Колпаков (30 мин)

    • Виртуальная клетка — агентная модель

  • Александра Касьянова (15 мин)

    • Реконструкция полноразмерных изоформ на основе длинных прочтений

  • Андрей Алексеевский (15 мин)

    • Множественное блочное выравнивание биологических последовательностей

  • Сергей Спирин (15 мин)

    • ​Филогенетические бенчмарки из аминокислотных и нуклеотидных выравниваний

  • Александра Иванова (15 мин)

    • Филогенетическая реконструкция трёх древних геномов Lautropia mirabilis.

​

11:30–12:00
Кофе-брейк

​​

12:00–13:30
Секция: Медицинская генетика

  • Василий Раменский (30 мин)

    • Исследование плейотропных генов моногенных заболеваний человека

  • Антон Буздин (15 мин)

    • Экспериментальный поиск ассоциации генетических вариантов с эндокринными заболеваниями

  • Геннадий Хворых (15 мин)

    • Биоинформатика в поиске генов сложных заболеваний: оригинальные методики

  • Сергей Иванов (15 мин) 

    • ​Выявление генов человека, связанных с риском развития большого депрессивного расстройства, на основе сочетанного анализа сигнальных сетей, геномных и транскриптомных данных

  • Дмитрий Мелешко (15 мин)

    • ​Haplotype-Resolved Genomes of a Russian Male and Female: A Resource for Structural Variant Discovery

​​

13:30–14:30
Обед

​

14:30–16:00
Секция: Генетика и медицина

  • Николай Кулемин (15 мин)

    • Скрытые технологические особенности секвенирования нового поколения

  • Анна Тимощук (15 мин)

    • A genome-wide association study in 10,000 individuals links plasma N-glycome to liver disease

  • Денис Маслов (15 мин)

    • ​Reconstructing N-Glycomes of Individual Glycoproteins from Total Plasma N-Glycome: Synthetic GWAS of Immunoglobulin G N-Glycosylation

  • Даниил Харитонов (15 мин)

    • ​От биоинформатического предсказания к валидации нарушения трансляции:  нарушение структуры uORF как причина наследственной патологии человека

  • Александра Филатова (15 мин)

    • ​Роль вариантов в старт-кодонах и последовательностях Козак в развитии наследственных заболеваний человека

  • Ксения Лупырь (15 мин)

    • ​Type 1 Diabetes Associated TCRs: Insights from Bulk TCR sequencing and Functional assays
       

​

16:00–16:30
Кофе-брейк

​

16:30–18:00
Секция: Рак

  • Константин Оконечников (30 мин)

    • Dissecting medulloblastoma clonal somatic structure through single-cell multi-omics

  • Никита Погодин (15 мин)

    • ​Phylogenetic analysis and expression analysis of processed human pseudogenes in glioblastoma

  • Роман Глушак (15 мин)

    • ​Исследование иммунного компонента опухолей разных подтипов HER2-отрицательного рака молочной железы с использованием методов транскриптомного анализа

  • Ринат Султанов (15 мин)

    • ​Идентификация энхансерных РНК, связывающихся с андрогеновым рецептором и связанных с прогрессированием рака предстательной железы

  • Антон Буздин (15 мин)

    • ​Проспективное клиническое исследование биоинформатической платформы анализа данных РНК-секвенирования Oncobox для персонализированного назначения таргетных препаратов онкобольным
       

​​

19:00–22:00
Неформальные обсуждения

​​​​​3 августа, воскресенье ∨

10:00–11:30
Секция: Протеомика и белки

  • Михаил Колоколов (15 мин)

    • Объединение данных дипольной ЭПР-спектроскопии с молекулярным моделированием

  • Мария Баранникова (15 мин)

    • Молекулярные механизмы регуляции ферроптоза

  • Франц Константинов (15 мин)

    • ​Идентификация нового потенциального ингибитора стволовой области гемагглютинина H1 вируса гриппа А 

  • Леонид Ивонцин (15 мин)

    • ​Мутационный анализ аминокислотных остатков протонных полуканалов бактериальной FoF1-АТФсинтазы

  • Алексей Финкельштейн (30 мин)

    • ​Стохастическое происхождение эффекта Мпембы в чистой воде: экспериментальное и теоретическое решение парадокса

​

11:30–12:00
Кофе-брейк

​

12:00–13:30
Секция: Белки и машинное обучение

  • Анна Тащилова (15 мин)

    • DrugForm-DTA: модель аффинности

  • Андрей Николаев (15 мин)

    • Инженерия лиганд-связывающих белков при помощи нейронных сетей

  • Денис Антонец (15 мин)

    • Enhancing the Reverse Transcriptase Function in Taq Polymerase via AI Driven Multiparametric Rational Design

  • Юрий Вяткин (15 мин)

    • ​DBP-Finder: Utilizing Large Language Models for Sequence-based Prediction of DNA-binding Proteins

  • Вениамин Фишман (30 мин)

    • Genome annotation and gene expression prediction using DNA Language Models

 

13:30–14:30
Обед

​

14:30–16:00
Секция: Регуляция и машинное обучение

  • Дмитрий Пензар (30 мин)

    • Открытый конкурс по предсказанию специфичности связывания факторов транскрипции

  • Ева Зубова (15 мин)

    • Улучшение предсказания активности цис-регуляторных последовательностей

  • Никита Пензин (15 мин)

    • ​Создание стандартизованного набора результатов массовых параллельных репортерных экспериментов для предсказания регуляторной активности коротких последовательностей с помощью машинного обучения

  • Андрей Буян (15 мин)

    • ​An atlas of transcribed gene regulatory elements reveals the diverse molecular phenotypes of human skeletal muscles

  • Арсений Зинкевич (15 мин)

    • ​PARADE: A computational framework for the evaluation and design of mRNA untranslated regions with enhanced tissue-specific activity

​

16:00–16:30
Кофе-брейк

​

16:30–18:00
Секция: Всякое интересное

  • Мария Попцова (15 мин)

    • ​Integrative Deep Learning Models for Predicting Protein-Protein Interactions

  • Мария Попцова (15 мин)

    • ​Совместный тканеспецифичный механизм действия мастер-регуляторов и G-квадруплексов, открытый с помощью моделей глубокого обучения 

  • Александра Козлова (30 мин)

    • ​Analysis of Oral Microbiome Diversity and the Lack of Distinct Orotypes in Metagenomic Profiles

  • Александра Денисова (30 мин)

    • ​Гены, лежащие в основе инновационности и решения проблем у птиц

  • Федор Колпаков (компьютерная демонстрация)

    • Анализ и интерпретация геномных данных

​​​

19:00–22:00
Farewell (to kings) party

bottom of page